Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NLRP1Q9C000 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NLRP1Q9C000 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NLRP1Q9C000 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NLRP1Q9C000 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NLRP1Q9C000 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NLRP1Q9C000 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NLRP1Q9C000 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NLRP1Q9C000 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NLRP1Q9C000 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NLRP1Q9C000 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
NLRP1Q9C000 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NLRP1Q9C000 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NLRP1Q9C000 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NLRP1Q9C000 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NLRP1Q9C000 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NLRP1Q9C000 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms