Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC13A1Q9BZW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC13A1Q9BZW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC13A1Q9BZW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC13A1Q9BZW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms