Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD2Q9BYW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD2Q9BYW2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD2Q9BYW2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SETD2Q9BYW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD2Q9BYW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms