Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED2Q9BTP6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms