Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG101Q9BSB4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG101Q9BSB4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG101Q9BSB4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms