Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SDF4Q9BRK5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDF4Q9BRK5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SDF4Q9BRK5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SDF4Q9BRK5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms