Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA1CQ9BQE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBA1CQ9BQE3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA1CQ9BQE3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA1CQ9BQE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA1CQ9BQE3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms