Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMKLR1Q99788 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMKLR1Q99788 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMKLR1Q99788 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CMKLR1Q99788 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms