Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD5Q99717 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD5Q99717 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAD5Q99717 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms