Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD9AQ99638 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD9AQ99638 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD9AQ99638 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD9AQ99638 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD9AQ99638 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD9AQ99638 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD9AQ99638 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD9AQ99638 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD9AQ99638 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD9AQ99638 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD9AQ99638 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD9AQ99638 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms