Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SIN3AQ96ST3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SIN3AQ96ST3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIN3AQ96ST3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SIN3AQ96ST3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SIN3AQ96ST3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms