Protein–RNA interactions for Protein: Q96RN1

SLC26A8, Testis anion transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A8Q96RN1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SLC26A8Q96RN1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SLC26A8Q96RN1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
SLC26A8Q96RN1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SLC26A8Q96RN1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SLC26A8Q96RN1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SLC26A8Q96RN1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SLC26A8Q96RN1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms