Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNGAP1Q96PV0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNGAP1Q96PV0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNGAP1Q96PV0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNGAP1Q96PV0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms