Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1MQ96MI6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1MQ96MI6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1MQ96MI6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPM1MQ96MI6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPM1MQ96MI6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPM1MQ96MI6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms