Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL38Q96DV4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL38Q96DV4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRPL38Q96DV4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL38Q96DV4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPL38Q96DV4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms