Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD1AQ96CP6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRAMD1AQ96CP6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms