Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDCCAG3Q96C92 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCCAG3Q96C92 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDCCAG3Q96C92 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDCCAG3Q96C92 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms