Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL26A1Q96A83 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL26A1Q96A83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL26A1Q96A83 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL26A1Q96A83 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL26A1Q96A83 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms