Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3AQ92664 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3AQ92664 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3AQ92664 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms