Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP205Q92621 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP205Q92621 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP205Q92621 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP205Q92621 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP205Q92621 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP205Q92621 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP205Q92621 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP205Q92621 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP205Q92621 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP205Q92621 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP205Q92621 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms