Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCN1Q92616 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCN1Q92616 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCN1Q92616 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCN1Q92616 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCN1Q92616 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCN1Q92616 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms