Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF4Q92544 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF4Q92544 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM9SF4Q92544 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF4Q92544 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms