Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC4Q8WW27 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC4Q8WW27 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC4Q8WW27 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC4Q8WW27 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms