Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFT2D1Q8WV19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFT2D1Q8WV19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D1Q8WV19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D1Q8WV19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms