Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM2BQ8NHM5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM2BQ8NHM5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM2BQ8NHM5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2BQ8NHM5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
KDM2BQ8NHM5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM2BQ8NHM5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms