Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EHBP1Q8NDI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHBP1Q8NDI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EHBP1Q8NDI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EHBP1Q8NDI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EHBP1Q8NDI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms