Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RDH13Q8NBN7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RDH13Q8NBN7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RDH13Q8NBN7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RDH13Q8NBN7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RDH13Q8NBN7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms