Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC105Q8IYK2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC105Q8IYK2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC105Q8IYK2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC105Q8IYK2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC105Q8IYK2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms