Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HS2ST1Q7LGA3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HS2ST1Q7LGA3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HS2ST1Q7LGA3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HS2ST1Q7LGA3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HS2ST1Q7LGA3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms