Protein–RNA interactions for Protein: Q76KD6

SPATC1, Speriolin, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATC1Q76KD6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATC1Q76KD6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATC1Q76KD6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATC1Q76KD6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms