Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS13CQ709C8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS13CQ709C8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS13CQ709C8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS13CQ709C8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS13CQ709C8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS13CQ709C8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS13CQ709C8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.9 ms