Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBR3Q6ZT12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBR3Q6ZT12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBR3Q6ZT12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
UBR3Q6ZT12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
UBR3Q6ZT12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
UBR3Q6ZT12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms