Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00575Q6W349 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00575Q6W349 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms