Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QL3Q5VWW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL3Q5VWW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QL3Q5VWW1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms