Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MEX3CQ5U5Q3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MEX3CQ5U5Q3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MEX3CQ5U5Q3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MEX3CQ5U5Q3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
MEX3CQ5U5Q3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
MEX3CQ5U5Q3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
MEX3CQ5U5Q3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MEX3CQ5U5Q3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MEX3CQ5U5Q3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MEX3CQ5U5Q3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
MEX3CQ5U5Q3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
MEX3CQ5U5Q3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MEX3CQ5U5Q3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MEX3CQ5U5Q3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MEX3CQ5U5Q3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MEX3CQ5U5Q3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MEX3CQ5U5Q3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MEX3CQ5U5Q3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MEX3CQ5U5Q3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms