Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SOGA3Q5TF21 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SOGA3Q5TF21 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SOGA3Q5TF21 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SOGA3Q5TF21 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOGA3Q5TF21 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SOGA3Q5TF21 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms