Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHYHD1Q5SRE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHYHD1Q5SRE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHYHD1Q5SRE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHYHD1Q5SRE7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms