Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRDTQ58F21 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRDTQ58F21 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRDTQ58F21 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRDTQ58F21 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRDTQ58F21 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRDTQ58F21 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRDTQ58F21 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRDTQ58F21 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRDTQ58F21 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRDTQ58F21 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms