Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFT2D3Q587I9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFT2D3Q587I9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFT2D3Q587I9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms