Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PABPC1LQ4VXU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PABPC1LQ4VXU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC1LQ4VXU2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC1LQ4VXU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms