Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF3Q3KNV8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF3Q3KNV8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF3Q3KNV8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.6 ms