Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBR1Q16650 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBR1Q16650 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBR1Q16650 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBR1Q16650 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TBR1Q16650 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
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