Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms