Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL9A2Q14055 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL9A2Q14055 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A2Q14055 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A2Q14055 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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