Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
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