Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNC4Q03721 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC4Q03721 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNC4Q03721 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms