Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSG1Q02413 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSG1Q02413 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG1Q02413 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DSG1Q02413 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DSG1Q02413 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms