Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITPNAQ00169 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNAQ00169 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNAQ00169 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms