Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL23AP62750 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL23AP62750 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL23AP62750 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL23AP62750 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL23AP62750 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL23AP62750 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL23AP62750 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL23AP62750 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL23AP62750 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL23AP62750 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL23AP62750 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL23AP62750 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL23AP62750 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL23AP62750 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPL23AP62750 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL23AP62750 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL23AP62750 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL23AP62750 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms