Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2MP61081 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2MP61081 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2MP61081 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 804 ms